Touma Kamijou é um estudante que vive em Academy City, um lugar altamente avançado em termos de tecnologia. Apesar de ser considerado um esper de nível zero (sem poderes), ele possui em sua mão direita o Imagine Breaker, uma habilidade que nega qualquer poder. Touma encontra uma jovem chamada Index que está tentando fugir da Necessarius, uma poderosa organização mágica da qual ela é membro. Abençoada com a habilidade de memorizar qualquer tipo de informação, ela possui 103.000 livros mágicos proibidos em sua cabeça. À medida que a ciência e a magia se cruzam, Touma precisa enfrentar vários perigos que aparecem na empolgante cidade científica.

Komori Yui é uma garota de pensamento positivo que, está preocupada por ver espíritos e experimentar fenômenos paranormais. Em seu segundo ano na escola ela transfere-se para uma nova escola para artistas e celebridades, devido ao trabalho de seu pai. Há rumores de que vampiros existem entre o corpo discente, e Yui acaba vivendo com os seis sádicos irmãos vampiros Sakamaki.

A história se passa no período Meiji do Japão, e mostra uma versão fictícia do poeta Takuboku Ishikawa, e do linguista Kyosuke Kindaichi, ambos amigos na vida real. O enredo começa quando Takubou se junta a um agencia de detetives particulares para sustentar sua família. Junto de Kindaichi, os dois começam a investigar casos de aparições de fantasmas na região de Ryoukai.

Em Tóquio, logo após a guerra, Kanna Kusakabe tinha acabado de se tornar um segundo ano em uma escola secundária quando conhece o novo professor de línguas, Akihiko Chuzenji. Misteriosos coisas sobrenaturais continuam acontecendo em torno de Kanna. Mais uma vez hoje, Kanna vai abrir as portas para a sala de preparação da biblioteca para procurar ajuda do malvado Chuzenji-sensei que está esperando dentro.

O Departamento de Diagnósticos Gerais do Hospital Geral Ten’ikai lida com casos que outros médicos consideram muito difíceis de tratar. É também onde mistérios bizarros vêm à tona, de doenças inexplicáveis ​​a assassinatos estranhos que nem a polícia consegue resolver. No centro de tudo isso está Ameku Takao, uma médica brilhante determinada a revelar a verdade chocante por trás dessas anomalias.

O advogado iniciante Naruhodo Ryuichi levanta-se para salvar seus clientes provando suas inocências nos casos mais incomuns! O réu é culpado ou inocente? Acreditando na inocência de seu cliente, Naruhodo vai à corte e batalha seus juízes rivais. Com a palavra "objeção!" e evidências limitadas, Naruhodo dá à volta por cima quando todas as chances estão contra ele e parece que não há mais nada a fazer. Não perca as cenas cômicas entre ele e seu mentor Ayasaho Chihiro, sua assistente Asayato Mayoi e seu promotor rival Mitsuguri Reiji e várias personagens únicas! O anime também mostrará a relação de infância entre Naruhodo e seus amigos. Com as habilidades que herdou de seu mentor, Naruhodo revela a verdade!

Na manhã do dia primeiro de agosto, nossa heroína acorda e descobre que não tem nenhuma memória do passado. É aí que um garoto aparece para ela e se apresenta como o espírito Orion, confiando nele, e contando com a sua ajuda, ela começa uma jornada para recuperar sua memória. Mas em seu caminho aparecem contratempos e peças do seu 'quebra-cabeça perdido', como: ligações que ela não consegue reconhecer o nome de quem estava ligando e se encontrar com aquele que parece ser seu "namorado", apesar de não reconhece-lo.